Tesis doctorales: TESEO

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Ministerio de Educación, Cultura y Deporte - Gobierno de España

Título: ECOLOGY AND EVOLUTION OF MICROBIAL NITRIFIERS
Autor: Fernàndez Guerra, Antonio
Universidad: Universidad de Barcelona
Departamento: C- GENETICA
Fecha de Lectura: 15/02/2013
Programa de doctorado: Genètica
Dirección:
- Ortega Casamayor, Emilio (Director)
- ROZAS LIRAS, JULIO ANTONIO (Tutor/Ponente)
Tribunal:
- PEDRÓS ALIÓ, CARLES (presidente)
- ABRIL FERRANDO, JOSEP FRANCESC (secretario)
- BORREGO MORE, CARLES (vocal)
Descriptores:
- MICROBIOLOGIA CLINICA
- GENETICA
- PROCESOS MICROBIANOS
- BIOLOGIA MOLECULAR DE MICROORGANISMOS
Marcador: https://www.educacion.gob.es/teseo/mostrarRef.do?ref=1018473Añadir a favoritos.
Resumen:
La oxidación del amonio es una de las piezas clave del ciclo del Nitrógeno. Tanto las bacterias como las arqueas oxidadoras del amonio se pueden encontrar coexistiendo a lo largo de diferentes ambientes. Pero cuando la primera arquea oxidadora del amonio fue aislada, se puso en relevancia la importancia de estas en comparación con las bacterias en los ciclos biogeoquímicos globales. Desde entonces hemos sido inundados por una avalancha de secuencias génicas de estas arqueas, mostrando una gran capacidad de diversificación y adaptación a ambientes diferentes. Al no disponer de suficientes datos para realizar una aproximación holistica utilizando genómica de poblaciones y de ecología inversa para poder discernir los mecanismos ecológicos y evolutivos relacionados con la adaptación; nos hemos centrado en estudiar la secuencia del amoA. La amonio monooxigenasa es la enzima responsable de la oxidación del amonio, para su estudio hemos aplicado una combinación de técnicas de ecología de comunidades y de evolución molecular con el objetivo de entender los mecanismos de los patrones de diversificación observados. Por otra banda, otro de los misterios asociados a la oxidación del amonio por parte de las arqueas, es su inusual bioquímica para realizar la oxidación del amonio. En arqueas faltan todos los elementos necesarios para llevar a cabo la oxidación del amonio a excepción del AMO. Para poder aportar algo de luz a este misterio hemos desarrollado un potente método basado en modelos gráficos para capturar todas las asociaciones funcionales presentes en los metagenomas basado en sus co-ocurrencias ecológicas.

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